Die betriebsindividuelle Verfahrensdokumentation bildet ein zentrales Element bei der Betriebsprüfung und hat maßgeblichen Einfluss auf deren Ergebnis. Außerdem werden in einer Verfahrensdokumentation die Prozesse und Systeme, Zuständigkeiten und Verantwortlichkeiten verdeutlicht. So können Abläufe wesentlich einfacher hinsichtlich Effizienz und Effektivität geprüft und optimiert werden.